英特尔、联想携手华大基因 加速新型冠状病毒基因组分析

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3月3日，英特尔、联想和BGI今天宣布，这三家公司正在合作加快covid-19新型冠状病毒的基因组特征分析。英特尔和联想的专业技术和生命科学专家将携手合作，为BGI研究人员提供全新的大数据分析技术和计算资源，进一步增强其基因测序工具的分析能力，更高效地研究新型冠状病毒的基因组特征。

华大dnbseq-t7序列发生器

英特尔和联想为BGI提供的技术包括一个大型高性能计算集群，可用于处理从BGI dnbseq-t7测序系统读取的高吞吐量数据。BGI研究人员将能够通过新的高性能计算和基因组分析技术，以及英特尔和联想的相关资源和专业知识，进一步加快对新型冠状病毒基因组特征的研究。这项技术将支持科学家研究病毒毒性、传播模式以及病原体和宿主之间的相互作用，进而帮助流行病学和疫苗设计研究。这些努力对于将来创造更好的诊断方法和设计有效的疫苗或其他保护措施(如免疫疗法)是必要的。

通过这次合作，BGI将继续优化其新型冠状病毒检测试剂盒，并获得大量有价值的信息。这些信息将有助于确定未来开发有效疫苗或治疗的潜在目标。通过英特尔和联想的共同努力，联想的超级计算技术支持并优化了“基因组优化和可扩展性工具”(简称goast，英特尔选定解决方案验证的第一个基因组分析工具)，可为全基因组测序和全外显子测序的计算提供高达40倍1的加速，并帮助华大基因优化计算过程，高效处理数据，更快生成可靠的基因组分析结果，从而缩短科学研究和临床观察的时间。

实验者正在操作华大dnbseq-t7序列器

“目前，我们对这种新型冠状病毒还有很多不了解的地方。通过分析病毒基因组数据，华大基因加快了对感染者的快速识别和基因组特征的研究，这些任务需要巨大的计算资源，而这正是我们可以发挥作用的地方。”英特尔营销集团副总裁兼中国区总经理王瑞表示:“因此，我们紧密合作，为在防疫第一线开展病毒研究的科学家提供更多的计算资源和专业支持，希望与狡猾的病毒展开竞争，帮助预防和控制疫情。拯救更多生命。”

联想集团高级副总裁、企业科技集团总裁佟福耀表示:“新型冠状病毒疫情影响全国人民的心灵。作为全球领先的高性能计算制造商，联想一直致力于为生命科学研究提供计算能力支持。英特尔和联想的大数据分析和健康与生命科学专家将整合我们的资源和专业知识，帮助解决当前面临的严峻挑战，促进健康与生命科学的发展。”

在基因测序中，每毫升体液通常包含数百万个不同的病毒体，每个病毒体的基因组包含大约30，000个dna碱基或字母。BGI正在对许多感染患者和疑似感染患者的微生物进行测序，因此这些研究将产生大量的结核病水平甚至铅水平的数据。为了高效快速地处理这些重要数据，有必要采用更先进的hpc基础设施、计算技术和优化的基因组分析方法。

BGI总部设在深圳，是专注于生命科学和基因研究的世界领先公司之一。首席信息官金说:“已经对数百个临床样本进行了测序，以分析和区分感染的并发症。生物信息学领域的技术，如基因组比对、基因组组装、基因组注释和病毒核酸片段的系统分析，都是一个高密度的计算过程，因此充分的高性能计算对于提高分析效率非常重要。能够使用最新的高性能计算和基因组分析技术是提高分析效率的一个重要因素。该设备和技术将加快新型冠状病毒感染者的快速鉴定和病毒基因组特征的研究，为新型冠状病毒的准确诊断、治疗和疫情防控提供有力支持。”

来源：零点娱乐时刊