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新型冠状病毒已经从“五大家族”转变为“两种亚型”了吗?


中新社北京三月四日电:新型冠状病毒已经从“五大家族”转变为“两种亚型”了吗?


中国新闻社记者张素


从被比作“五个家族”到被分析为“两个亚型”,最近几天许多关于新型冠状病毒的研究都隐藏着一个核心问题:新型冠状病毒发生了变化吗?


国内外的研究都指向病毒突变


3日发表在《国家科学评论》上的《论sars-cov-2的起源和可持续进化》一文指出,通过对103个新型冠状病毒基因组的分子进化分析,新型冠状病毒进化出两个亚型:L型和s型


本文作者、北京大学生命科学学院生物信息学中心研究员陆健和中国科学院上海巴斯德研究所研究员崔杰发现,新的冠状病毒最近发生了149个突变点,L和S亚型的差异在于病毒rna基因组的28144位点。文章还得出结论,S型相对较老,攻击性较弱。

从“五个家族”到“两个亚型” 新冠病毒变了吗?


中国医学科学院北京协和医院、中国疾病预防控制中心、加州大学洛杉矶分校等五家机构的研究人员2日在预印网站biorxiv上联合发表了一篇关于新型冠状病毒进化过程中的突变、重组和插入的研究报告。他们收集并分析了120种新型冠状病毒的基因组序列,并提出根据核苷酸位置8517和27641,病毒株可分为两大类。

从“五个家族”到“两个亚型” 新冠病毒变了吗?


巴西科学家和英国科学家在南美洲联合发表了第一份新的冠状病毒报告。本研究收集了巴西圣保罗一名61岁男性患者的病毒基因,命名为“巴西/spbr1/2020”。与中国公布的“hu-1参考株”相比,这种巴西病毒的基因组有三个突变点,但更接近于从德国慕尼黑患者身上提取的“德国/巴伐利亚1/2020株”。

从“五个家族”到“两个亚型” 新冠病毒变了吗?


此前,来自西双版纳热带植物园、中国科学院等机构的研究人员收集了93个新的冠状病毒样本的基因组数据,获得了58个单倍型,这些单倍型被分为5个abcde组,这些组后来被描述为病毒的“5个家族”。


突变是如何变化的?不同的筛选标准


以上所有研究都证实了病毒发生了变异,但基于变异的归纳分类并不一致。对此,一位长期关注相关问题的生物学家4日告诉中国新闻社,病毒总是会发生变异,分类就像筛选病毒,“筛子”的形状和厚度决定了分类的类型和数量。

从“五个家族”到“两个亚型” 新冠病毒变了吗?


这位生物学家强调,为了得到准确的分类,有必要将基因组序列的变化与病毒的现实表现相匹配,如发病时间、发病区域、传播途径和临床表现。


以科研团队追踪非典病毒为例。2004年1月30日,全国非典防控研究小组和广东省非典防控领导小组宣布,中国科学家从流行病学和分子进化的角度对2002/2003年非典疫情的早期、中期和晚期进行了界定,并对每个阶段的基因组分子标记进行了界定,从而分析了非典冠状病毒的分子进化规律。

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需要指出的是,与世界上COVID-19的肺炎确诊病例数相比,仅分析和上传了130个基因组序列。一些学者呼吁对世界范围内特别是武汉地区的COVID-19肺炎患者进行大规模病毒基因序列分析,并结合患者的发病情况,以得出更可靠的结论。

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如何看待突变?没有必要过度恐慌


知道了新型冠状病毒的突变,人们担心这种病毒是否已经变异甚至进化了。在这里,我们需要首先澄清这个概念。生物学将变异大致分为两个方面:“突变”和“基因重组”。


耶鲁大学、悉尼大学和其他大学的研究人员在2月19日发表在《自然微生物学》上的一篇评论文章回答说:突变是病毒生命周期的自然组成部分,特别是对于rna病毒来说,突变是“不寻常的”。突变可以增强或减弱病毒的毒性。病毒的毒性和传播方式由多个基因控制,换句话说,进化需要多个突变。任何关于突变后果的陈述都需要实验和流行病学证据。“不应该对病毒变异感到恐慌”。

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通过梳理最近的研究也可以发现一些“好消息”。中国科学院版纳热带植物园的一项研究称“新的冠状病毒基因组中没有重组事件”;南方医科大学的学者发现,117个突变点在整个基因组中分布相对均匀,表明“没有任何特殊的‘激进’突变”。中国-世界卫生组织新型冠状病毒联合专家调查组也表示,在新型冠状病毒中没有发现明显的变异。

从“五个家族”到“两个亚型” 新冠病毒变了吗?


中山大学第三附属医院传染科副主任、《国际病毒学杂志》副总编林4日在接受中国新闻社采访时表示,基因突变可能会改变病毒的致病性和传播性。“从理论上讲,大多数疾病的致病性在传播后会降低,但也有一些会增加,如更容易吸附细胞”,这将对防治和临床实践产生影响,因此需要进一步的观察和研究。

从“五个家族”到“两个亚型” 新冠病毒变了吗?



来源:零点娱乐时刊

标题:从“五个家族”到“两个亚型” 新冠病毒变了吗?

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